水處理殺菌劑又稱殺菌滅藻劑，是一類能抑制水中菌藻和微生物的滋長，以防止形成微生物粘泥，對系統造成危害的化學藥品。包括氧化性殺菌劑，如氯氣、次氯酸鈉、漂白粉、臭氧、氯胺等；非氧化性殺菌劑，如氯化十二烷基二甲基芐基銨、溴化十二烷基二甲基芐基銨、二硫氰基甲烷等；重金屬化合物，如氧化汞、氯化汞、氟化汞等；粘泥殺菌劑，如松香胺、過氧化氫、又胍聚合物等。


二氧化氯溶液ClO2


二氧化氯是一種強氧化劑,不致癌、無致畸、無突變作用。二氧化氯與氯氣相比具有以下優點：不僅能殺死一般微生物，而且具有殺真菌孢子，殺病毒等作用；不與氨、酚和不飽和化合物作用； PH變化對殺菌效果影響甚小，故特別適用于用于化肥廠循環水中作殺生劑；可完全代替氯氣和非氧化性殺生劑，因此十分經濟。


戊二醛


戊二醛幾乎無毒,適用范圍寬,耐較高溫度,，是殺硫酸鹽還原菌的特效藥，其本身可以生物降解。其缺點是與氨、胺類化合物發生反應而失去活性，因此在漏氨嚴重的化肥廠不宜使用。


聚季銨鹽


聚季銨鹽絮凝殺菌劑屬強陽離子高分子聚合物，在水中有很好的溶解性能，屬非氧化性殺菌劑絮凝劑。廣泛應用于石油、化工、電力等行業的循環冷卻水系統中，用以控制循環冷卻水系統菌藻滋生，對殺滅大腸桿菌有特效。聚季銨鹽殺菌劑絮凝劑可作為紡織印染行業的殺菌防霉劑及柔軟劑、抗靜電劑、乳化劑、調理劑等，還可以用于洗化行業作為表面活性劑等。 


季膦鹽


它的出現是目前水處理殺菌劑新進展之一。這類化合物與季銨鹽有著相似的結構,只是以磷陽離子代替氮陰離子。迄今雖然對它的各種性能參數認識并不全面,但它用于工業水處理及油田水處理確實具有高效、快速、廣譜,對環境、魚類具有低毒，易生物降解和使用方便等優點。


異噻唑啉酮


異噻唑啉酮主要由5-氯-2-甲基-4-異噻唑啉-3-酮（CMI）和 2-甲基-4-異噻唑啉-3-酮（MI）組成。異噻唑啉酮是通過斷開細菌和藻類蛋白質的鍵而起殺生作用的。異噻唑啉酮微生物接觸后，能迅速地不可逆地抑制其生長，從而導致微生物細胞的死亡，故對常見細菌、真菌、藻類等具有很強的抑制和殺滅作用。殺生效率高，降解性好，具有不產生殘留、操作安全、配伍性好、穩定性強、使用成本低等特點。能與氯及大多數陰、陽離子及非離子表面活性劑相混溶。高劑量時，異噻唑啉酮對生物粘泥剝離有顯著效果。 
所以，異噻唑啉酮是一種廣譜、高效、低毒、非氧化性殺生劑。廣泛運用于油田、造紙、農藥、切削油、皮革、油墨、染料、制革等行業。


復配型


近年來人們仍不斷尋找新的非氧化性水處理殺菌劑，廣譜高效，對菌、藻均有效,pH影響小,低毒環保、性能/價格比好且易于使用和運輸。然而，開發新的非氧化性水處理殺菌劑耗資巨大,需要時間長。這樣,如何通過復配已有的非氧化性水處理殺菌劑，使之產生增效、互補作用,藥劑投加量減少，費用降低。因此,使用復合非氧化性水處理殺菌劑成為近年來的又一個發展新趨勢。